Les abattoirs jouent également un rôle important dans la chaîne de biosécurité pour le secteur porcin. Les cours d’abattoirs accueillent les camions de transport d'animaux qui peuvent constituer des vecteurs de propagation d’agents pathogènes. Par conséquent, il est important que les abattoirs aient un programme de biosécurité.
Voici deux documents d’information sur les mesures de biosécurité pour les abattoirs produits par l’ancien Conseil canadien de santé porcine.